خبرگزاری بحرین«بنا» به نقل از وزارت کشور بحرین گفت«قاسم 79 ساله اقدام به تأسیس تشکیلات وابسته به کشورهای خارجی کرد ونقش اصلی ومخرب در ایجاد تنش مذهبی وآسیب رساندن به وحدت ملی کشور بحرین داشت. وبنابه قانون تابعیت وثبت احوال کشور بحرین، هیئت وزیران بحرین با دستور سلب تابعیت بحرینی عیسی قاسم موافقت کرد.»
سایت مشرق نیوز در مورد قاسم نوشته است: حضرت آيت الله العظمي خامنهاي، رهبر معظم انقلاب اسلامي، آيت الله شيخ عيسي قاسم را "ستارهاي در آسمان تشيع" توصيف نموده و فرمودند: «اينجانب به وجود شيخ افتخار ميکنم.»
حجت الاسلام والمسلمين شيخ "اسد قصير" از اعضاي دفتر استفتائات مقام معظم رهبري که مسؤوليت انتقال استفتائات مقلدان عرب زبان معظم له را بر عهده دارد، درباره ديدگاه ولي امر مسلمين در مورد شيخ قاسم گفته است: «اگر من هم در بحرين بودم خود را ملتزم به ديدگاه ها و مواضع سياسي حضرت شيخ عيسي مي دانستم و اگر از سيدنا القائد نيز سؤال شود قطعاً پاسخ ايشان نيز همين خواهد بود.»
آيت الله محمدتقي مصباح يزدي نيز درباره شيخ عيسي قاسم گفته است: «من پيش از سفرم به بحرين، شيخ عيسي را که از اعضاي مجمع جهاني اهل بيت(ع) و نماينده آيت الله خامنهاي مدظله العالي بودند، ميشناختم. سابقه آشنايي من با ايشان به جلسات مجمع و حضور ما در آنجا بازميگردد و من هيچگاه جز علم و تقوا و پرهيزگاري چيزي از ايشان نديدم و با هيچ يک از علماي بحرين به اندازه شيخ عيسي آشنا نيستم و نميتوانم آنها را با شيخ عيسي مقايسه کنم.»
گفته می شود که کشور کویت نیز در سال 2014 تابعیت شیخ نبیل العوضی یکی از روحانیان برجسته أهل سنت این کشور را به دلایلی مشابه لغو تابعیت روحانی شیعه بحرینی لغو کرد.